1、可以通过控制蜂箱的温度去控制蜂王的自然交尾，蜂王的交尾虽然是一种自然现象，但是它对外界气温的要求有着严格的控制，只是在外界温度超过二十度的时间才会去婚飞，并且与雄蜂交配，如果大家不想让蜂王自然交尾，可以把蜂箱的温度适当降低一些。
2、蜂农也可以用空间隔离法去控制蜂王的自然交尾，在这以前蜂农要先了解一下蜂王婚飞的距离，处于平原地区的蜂王，婚飞时可以在直径为十八千米之内的范围中飞行，如果是生活在山区之中的蜂王，它婚飞时只能飞行在方圆五公里以内，了解了这些以后，蜂农就可以把自己的蜂群的交尾场安置在与其他蜂场超过二十公里的地方，这样自己的蜂王就不会出现自然交尾，而是只能与自己养殖的雄蜂进行交尾了。
3、蜂农用时间隔离法也可以控制蜂王自然交尾的出现，也就是说在自己附近其他蜂场中蜂王与雄蜂没有培育出来以前，自己就要让自己的蜂王和雄蜂培育成功，并且在自己的蜂场中完成交尾。在其他蜂场雄蜂没有成熟的情况下，蜂王就不会自然交尾，而是与蜂农为它们准备的雄蜂进行交尾。